Na 5º Temporada repleta de ação de Stargate Atlantis, faíscas voam quando Woosley assume a liderança do Time Atlantis enquanto McKay enfrenta problemas pessoais. Teyla tenta equilibrar suas funções enquanto mãe e guerreira; o passado de Ronan volta para vingança e Keller encontra problema e solução de uma fonte improvável. A relação com Wraith toma um novo rumo e novos inimigos curam o caminho da equipe para por à prova sua coragem e o destino.