Gon Freaks vive na Ilha da Baleia junto com sua tia Mito. Um dia, enquanto caminha pela floresta, é salvo de um urso-raposa por um Hunter, espécie de aventureiro que passa a vida em busca de tesouros e raridades. Com este homem Gon descobre que seu pai não está morto e é um dos mais famosos Hunters do mundo. Assim, resolve iniciar uma jornada para reencontrar seu pai. Fora da ilha da Baleia, ele chega a uma cidade onde conhece Leorio, um jovem que também pensa em prestar o teste para se tornar um Hunter. Depois de ajudarem os animais de um estranho circo, eles embarcam num navio. Ali, conhecem Kurapika e acabam se tornando amigos. Quando a viagem termina os três partem juntos para o Exame Hunter, no qual terão que responder uma estranha pergunta em uma misteriosa cidade.